Berandasehat.id – Akhir tahun lalu, studi pendahuluan mengungkap bahwa varian Omicron yang menyebar cepat kemungkinan akan menghindari antibodi COVID-19. Kini, salah satu studi dari Karolinska Institutet telah diterbitkan dalam jurnal The Lancet Infectious Diseases, peneliti Ben Murrell menjelaskan temuan untuk memahami varian baru.
Pada akhir November 2021, varian baru SARS-CoV-2 diidentifikasi oleh para ilmuwan di Afrika Selatan, yang kemudian dikenal sebagai Omicron. Seiring dengan sinyal awal bahwa itu menyebar dengan cepat, alarm internasional dibangkitkan oleh jumlah mutasi pada protein spike Omicron, yang merupakan bagian yang ditargetkan oleh antibodi penetral. Hal ini mengawali penelitian ilmiah untuk mengkarakterisasi seberapa luas Omicron akan menghindari antibodi penetral.

“Saat ini, kami biasanya menggunakan sintesis gen untuk membuat gen lonjakan (spike) baru untuk mengukur netralisasi antibodi,” kata Ben Murrell, asisten profesor di Departemen Mikrobiologi, Tumor dan Biologi Sel, Karolinska Institutet, dan penulis terakhir studi tersebut.
Ketika berita varian pertama pecah, Ben Murrell menempatkan pesanan sintesis. Namun, segera setelah ini, kasus mulai muncul di Eropa, dan laboratorium Ben Murrell menyadari bahwa mungkin ada cara yang lebih cepat untuk membuat uji netralisasi Omicron.
Melalui kolaborasi dengan Profesor Jan Albert, yang telah mengurutkan varian SARS-CoV-2 di Swedia, laboratorium Ben Murrell memperoleh sampel anonim dari dugaan infeksi Omicron. Mereka mampu mengkloning bagian dari gen spike yang mengandung mutasi Omicron ke dalam tulang punggung spike yang mereka gunakan untuk uji netralisasi.
“Daniel Sheward, yang menjalankan pengujian ini di lab saya, (bekerja) sangat cepat. Kami dapat merilis hasil netralisasi pertama kami delapan hari setelah mendapatkan sampel itu, yang hanya 13 hari setelah varian dilaporkan ke WHO,” terang Ben Murrell.
Saat para peneliti mendekati langkah terakhir, mereka menjangkau rekan-rekan di Afrika Selatan yang juga bekerja untuk memahami varian baru, tetapi menggunakan pendekatan yang berbeda.
“Laboratorium Afrika Selatan telah memiliki akses ke sampel Omicron sejak awal dan mencoba menumbuhkan virus Omicron hidup di lab, dan menggunakan ini untuk mengukur netralisasi,” kata Ben Murrell.
“Mereka memberi tahu kami bahwa tim juga menghasilkan hasil awal pada waktu yang hampir bersamaan dengan kami. Jadi kami memutuskan untuk membandingkan catatan dan kemudian segera merilis data,” beber Ben Murrell.
Tetapi ketika mereka membandingkan catatan, hasil Afrika Selatan terlihat berbeda. Data Afrika Selatan menunjukkan hilangnya netralisasi antibodi yang jauh lebih substansial terhadap Omicron daripada data dari dua kohort dari Stockholm. Hasil dari Stockholm juga menunjukkan bahwa kerugiannya sangat bervariasi: Beberapa orang menetralkan Omicron hampir sama seperti mereka menetralkan varian asli SARS-CoV-2, tetapi yang lain kehilangan banyak potensi melawan Omicron.
“Perbedaan awal ini sangat menegangkan pada awalnya. Itu adalah pertanyaan penting untuk dijawab dengan cepat, tetapi sangat penting agar jawaban ini benar,” jelas Ben Murrell.
Laboratorium menghabiskan berjam-jam berikutnya untuk memeriksa ulang semuanya sebanyak mungkin, dan kemudian merilis data mereka secara publik, bersama dengan peringatan yang sesuai untuk hasil awal seperti ini. Pada hari dan minggu berikutnya, lab lain mulai merilis data.
“Gambarannya menjadi sangat jelas. Kemampuan untuk menetralkan silang Omicron tampaknya sangat bergantung pada berapa kali sistem kekebalan kita terpapar, baik melalui infeksi atau melalui vaksinasi, terhadap spike SARS-CoV-2,” jelas Ben Murrell.
Inilah sebabnya mengapa data dari kohort pekerja rumah sakit Stockholm yang sebelumnya terinfeksi kemudian divaksinasi menunjukkan netralisasi silang Omicron yang jauh lebih substansial daripada kohort yang dipelajari di Afrika Selatan.
“Sangat menarik untuk melihat bahwa donor darah Swedia yang dipilih secara acak juga menunjukkan netralisasi Omicron yang substansial—tidak sebanyak pekerja rumah sakit, tetapi lebih dari yang kami harapkan,” tambah Ben Murrell.
Beberapa hari kemudian, laboratorium merilis data netralisasi untuk antibodi monoklonal yang relevan secara klinis, yang digunakan untuk mengobati COVID-19. Ini menunjukkan bahwa banyak antibodi terapeutik dibuat tidak efektif oleh Omicron. Salah satunya, Sotrovimab, mempertahankan sebagian besar potensinya melawan Omicron, yang sesuai dengan data yang baru saja dirilis oleh pengembang Sotrovimab. “Data kami berasal dari garis keturunan BA.1 Omicron, yang dominan pada saat itu, tetapi data terbaru dari laboratorium lain menunjukkan bahwa BA.2, yang menyalip BA.1 secara global, tampaknya berbeda di sini,” Ben Murrell memperingatkan.
Pentingnya Vaksinasi
Publikasi, yang sekarang telah ditinjau oleh rekan sejawat, mendokumentasikan hasil awal tersebut, dan telah menambahkan beberapa lagi, meningkatkan ukuran kohort donor darah acak, di mana gambarnya tidak berubah, dan termasuk sampel yang terinfeksi sebelumnya yang diambil sebelum vaksinasi.
“Sampel yang terinfeksi tetapi tidak divaksinasi ini menunjukkan hilangnya netralisasi total terhadap Omicron, yang menunjukkan bahwa kita tidak dapat mengandalkan infeksi alami untuk membuat antibodi yang baik terhadap varian yang lebih bermutasi ini. Artinya, vaksinasi penting,” ujar Ben Murrell.
“Penetralan silang yang kami lihat pada orang yang telah terinfeksi kemudian divaksinasi kemudian dikonfirmasi juga terjadi pada orang yang menerima dosis vaksin penguat ketiga,” tandas Ben Murrell dilaporkan MedicalXpress. (BS)