Berandasehat.id – Sebuah studi molekuler yang diterbitkan di jurnal Science mengungkapkan bagaimana mutasi pada varian Delta dan Kappa coronavirus membantu varian ini menghindari pengenalan oleh antibodi.

Sebagian besar pengembang vaksin berkonsentrasi pada penargetan lonjakan glikoprotein pada permukaan virus corona. Glikoprotein spike mencakup domain terminal-N yang meningkatkan pengikatan sel, dan domain pengikatan reseptor yang terlibat dengan reseptor ACE2 pada sel inang.

Sebagian besar antibodi terhadap virus corona menempel pada situs tertentu pada dua domain ini. Akibatnya, varian coronavirus telah bermutasi pada domain terminal-N dan domain pengikatan reseptor untuk menghindari antibodi ini, seperti halnya varian Delta dan Kappa.

“Ini adalah target utama dari antibodi penetral pada individu yang baru sembuh dan divaksinasi, sehingga meningkatkan kekhawatiran tentang khasiat vaksin yang tersedia dan antibodi terapeutik terhadap varian [Kappa dan Delta] ini,” tulis para peneliti dalam makalah Science.

Ilustrasi virus corona (dok. istimewa)

Projek yang dilaporkan itu dipimpin oleh lab David Veesler di Departemen Biokimia di Fakultas Kedokteran Universitas Washington di Seattle. Veesler juga seorang Investigator dari Howard Hughes Medical Institute. 

Penulis utama penelitian ini adalah Matthew McCallum dan Alexandra Walls, keduanya dari Departemen Biokimia Fakultas Kedokteran UW.

Para ilmuwan memperoleh sampel plasma dari 37 orang, dengan rentang usia 22 hingga 66 tahun, yang telah menerima dua dosis Moderna atau Pfizer/BioNtech atau satu dosis vaksin Covid-19 buatan Janssen.

Data menunjukkan bahwa varian Delta, Kappa dan Delta Plus mengurangi potensi penetral virus dari antibodi yang diinduksi vaksin. Varian Delta Plus menyebabkan penurunan terbesar. Antibodi dari setengah individu yang divaksinasi Janssen benar-benar kehilangan kemampuan untuk menetralkan satu atau lebih varian dalam uji laboratorium.

Meskipun varian Kappa dan Delta Plus lebih mampu menghindari netralisasi antibodi yang ditimbulkan oleh vaksin, varian Delta-lah yang menjadi dominan di seluruh dunia pada awal musim panas ini. Insidennya yang tinggi secara global sejalan dengan kemampuannya untuk menyebar lebih mudah, lebih cepat bereplikasi dan menciptakan viral load yang lebih besar di hidung dan tenggorokan orang yang terinfeksi. 

Para peneliti mengatakan bahwa penelitian lebih lanjut akan diperlukan untuk mengeksplorasi kemungkinan interaksi apa pun antara penghindaran kekebalan dan peningkatan penularan sebagai strategi evolusi varian untuk mencapai dominasi global sebagai penyebab utama infeksi Covid.

Para peneliti kemudian menggunakan cryoelectronmicroscopy untuk memeriksa dengan cermat struktur infektivitas utama dalam varian virus corona. Mereka ingin memahami bagaimana mutasi varian menurunkan sensitivitas terhadap antibodi. Varian Delta muncul dengan solusi molekuler yang unik, termasuk yang peneliti gambarkan sebagai “remodeling mencolok dari domain terminal-N” yang menggarisbawahi plastisitasnya dalam menghindari antibodi yang ditujukan padanya.

Satu antibodi, yang disebut S2X303, menonjol karena kemampuannya dalam bereaksi silang dengan beberapa varian, dibandingkan dengan semua antibodi penetral lainnya. 

Dengan mengeksplorasi bagaimana antibodi ini terikat pada domain terminal-N, para ilmuwan mendapatkan gambaran yang lebih jelas tentang bagaimana antibodi ini menyerang targetnya. Antibodi ini mengambil sudut pendekatan yang tidak biasa untuk membuat jejak kontak yang unik dalam domain terminal-N.

Terlepas dari kecenderungan virus untuk mengatasi pertahanan kekebalan dan menolak pengobatan, ada beberapa harapan di cakrawala S309, induk dari antibodi COVID-19 yang telah menerima otorisasi penggunaan darurat FDA, sejauh ini efektivitasnya belum berkurang karena perubahan genetik pada pandemi virus corona. 

Ia bekerja dengan mengenali bagian dari domain pengikatan reseptor yang tidak berubah. Baru-baru ini juga ditemukan antibodi lain yang dapat mengenali bagian dari domain pengikatan reseptor yang tetap dipertahankan pada beberapa spesies dan galur sarbecovirus.

Temuan itu mungkin mengarah pada pengembangan klinis lebih banyak antibodi untuk pencegahan dan pengobatan COVID-19.

Penemuan antibodi virus corona yang memiliki kemampuan penetralan secara luas juga memberikan informasi ide-ide vaksin COVID-19 yang baru. Para ilmuwan sudah bekerja pada kandidat vaksin generasi berikutnya yang mungkin dapat menghasilkan kekebalan luas terhadap sarbecovirus. Hal itu memungkinkan pembuatan vaksin beta-coronavirus universal. (BS)