Berandasehat.id – Para peneliti di Case Western Reserve University menemukan variasi genetik yang luas pada virus SARS-CoV-2 di antara 360 pasien yang infeksi virusnya diurutkan secara genetik, menunjukkan bahwa semua infeksi individu mencakup berbagai varian virus.
Para peneliti mencatat bahwa pelaporan tentang virus biasanya menyoroti varian dominan tunggal, yang mengarah pada variasi genetik virus yang kurang dilaporkan dan dapat memiliki konsekuensi serius dalam perencanaan dan respons kesehatan masyarakat.
“Riset kami memberikan perhatian pada kompleksitas penyakit menular yang sering kali terlalu disederhanakan ketika mempertimbangkan hanya virus yang paling melimpah dalam infeksi, dan kami menunjukkan pentingnya memeriksa variasi yang secara historis dianggap kebisingan,” kata Ernest (Ricky) Chan , direktur inti bioinformatika di Cleveland Institute for Computational Biology di Case Western Reserve School of Medicine.
“Kami melihat bahwa varian genetik yang diamati dalam frekuensi rendah pada infeksi SARS-CoV-2 dapat menjadi indikator awal dari strain baru yang bertanggung jawab atas lonjakan penularan di kemudian hari,” imbuhnya.
Makalah berjudul “Infeksi dan Penularan COVID-19 Termasuk Keanekaragaman Urutan Kompleks” diterbitkan pada 8 September 2022 di PLOS Genetics.
Tim CWRU melakukan sekuensing genom penuh virus SARS-CoV-2 dari 250 pasien di Northeast Ohio dan menggunakan data serupa dari 110 pasien lain dengan sekuens genetik lengkap dari virus yang menginfeksi yang disediakan melalui kolaborator penelitian internasional.
Data ini dikembangkan pada hari-hari awal pandemi COVID-19 ketika varian Alpha dan kemudian varian Delta menjadi perhatian utama. Pekerjaan ini menunjukkan bahwa mutasi yang ditemukan di Omicron BA.1 dan BA.2 sudah ada sebagai variasi yang relatif kecil setidaknya setahun sebelum Omicron dan banyak iterasinya menyebutnya sebagai “varian yang menjadi perhatian.”
Omicron dan variannya sendiri menjadi pusat kebangkitan besar COVID-19 musim dingin lalu.
“Konsentrasi pada konsensus mayoritas varian virus dalam komunitas riset global mengalihkan perhatian dari variasi genetik yang dapat berkontribusi secara signifikan terhadap evolusi berkelanjutan dari pandemi COVID-19,” kata Peter Zimmerman, seorang profesor di Departemen Patologi di School of Obat-obatan. {EMBED LINK TO BIO} “Fokus pada varian mayoritas adalah langkah pertama yang penting dalam pengembangan diagnostik, terapi, dan vaksin, namun komunitas peneliti perlu mengukur dan melaporkan variasi, sehingga komunitas kesehatan masyarakat dan masyarakat umum lebih siap dan gesit dalam menanggapi virus yang terus berkembang.”
Banyak yang terus dilakukan untuk menentukan dan melacak munculnya garis keturunan virus di seluruh evolusi SARS-CoV-2 yang sedang berlangsung di seluruh dunia. Untuk kepentingan waktu, peneliti global telah mengandalkan pelacakan dan pelaporan pada variasi yang relatif dominan.
Tetapi para peneliti CWRU mencatat bahwa, mengingat berbagai variasi dalam infeksi tunggal, penting untuk melaporkan representasi yang lebih lengkap dari urutan genetik virus untuk memahami bagaimana perubahan genetik ini dapat menyebar dan berpotensi berinteraksi dengan berbagai kategori kondisi pasien, termasuk upaya pemberantasan virus. (BS)
berandasehat.id 