Berandasehat.id – Sejak Juni 2022, jumlah infeksi COVID-19 mulai meningkat lagi, karena varian Omicron yang paling menular mulai mengambil alih mutasi varian Delta yang mengarah ke subvarian baru BA.4/BA.5 dan varian Deltacron.
Dari kelima varian mengkhawatirkan yang diketahui, yakni terbukti mampu menghindari antibodi terapeutik dan vaksin yang dikembangkan melawan virus SARS-CoV-2 asli yang tidak bermutasi, Delta adalah yang paling ganas yang menyebabkan gejala parah dan peningkatan kematian di antara orang yang terinfeksi.
Sebuah studi peer-review (ditinjau rekan sejawat) baru memberikan jawaban mengapa Delta adalah varian paling mematikan dari SARS-CoV-2.
Untuk menjawab pertanyaan kritis ini, para peneliti di Fakultas Farmasi dan Ilmu Farmasi Universitas Colorado Skaggs melakukan analisis biofisik yang kuat pada varian Delta dan mutasi individu yang membentuk varian itu.
“Temuan kami membantu menjelaskan mengapa pasien yang telah divaksinasi masih dapat terinfeksi oleh varian baru dan mengapa pasien yang telah tertular varian Delta lebih mungkin dirawat di rumah sakit,” kata penulis Krishna Mallela, Ph.D., profesor di departemen ilmu farmasi di CU Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences yang berlokasi di Kampus Medis Universitas Colorado Anschutz.
Peneliti Casey Patrick, Vaibhav Upadhyay dan Alexandra Lucas dari laboratorium Mallela mengidentifikasi efek dari residu yang bermutasi dalam receptor binding domain (RBD), yakni tempat di mana SARS-CoV-2 mengikat reseptor ACE2 yang menurunkan kapasitas netralisasi antibodi yang disetujui dan plasma poliklonal dari pemulihan pasien.
“Karena fakta bahwa kita tahu vaksin menjadi kurang efektif melawan varian SARS-CoV-2 yang muncul, penting untuk memahami mutasi apa yang menyebabkan penurunan kapasitas netralisasi ini,” kata Mallela.
Para ilmuwan menguraikan informasi penting tentang residu mutasi yang sekarang sering terjadi pada varian SARS-CoV-2. “Karena telah melakukan analisis individu pada mutasi ini, kami memiliki pemahaman dasar tentang bagaimana beberapa residu mempengaruhi pelepasan kekebalan dan infektivitas SARS-CoV-2,” kata Mallela.
Para peneliti menemukan Delta menampilkan karakteristik biofisik yang unik tidak seperti varian Alfa, Beta, dan Gamma sebelumnya. Sistem kekebalan tubuh manusia menghasilkan antibodi untuk menetralkan virus sebagai respons terhadap infeksi virus. Antibodi penetral ini telah diklasifikasikan ke dalam kelas yang berbeda, tergantung pada lokasi epitopnya di RBD, dan beberapa antibodi ini sebelumnya telah disetujui untuk penggunaan darurat oleh FDA.
Hasil dari lab Mallela menunjukkan varian Delta telah berevolusi menuju pelepasan antibodi kelas 2 dan kelas 3, daripada meningkatkan pengikatan reseptor atau pelepasan antibodi kelas 1. Antibodi kelas 1 mengikat RBD hanya dalam konformasi atas di mana RBD dapat diakses oleh pengikatan ACE2, sedangkan antibodi kelas 2 dan kelas 3 mengikat RBD terlepas dari apakah itu dalam konformasi atas (dapat diakses oleh ACE2) atau konformasi bawah (tidak dapat diakses oleh ACE2).
Delta juga menunjukkan ekspresi protein yang lebih tinggi. Satu mutasi pada varian Delta, T478K, diyakini telah berevolusi dari pasien yang terinfeksi dengan varian sebelumnya SARS-CoV-2. Mutasi ini telah terbukti lolos dari antibodi yang dihasilkan dari infeksi COVID-19 terdahulu.
Hasilnya menunjukkan bahwa pelarian kekebalan dari antibodi penetral adalah parameter biofisik utama yang menentukan lanskap kebugaran varian yang muncul.
Studi ini diterbitkan dalam Journal of Molecular Biology edisi terbaru dan ditampilkan di sampul jurnal. (BS)
berandasehat.id 